Batman i Robin rozpoczynają poszukiwania Supermana. W biurze Luthora znajdują fiolkę ze śladami zarodników Poison Ivy. Bohaterowie kontynuują swoje poszukiwania w wojskowym laboratorium Lexa w Gotham City. Na miejscu Nietoperz znajduje zamkniętą Poison Ivy. Chwilę później zostaje zaatakowany przez Clayface'a, ale pokonanie go nie jest dużym problem dla bohatera. Jednak nie jest to jedyny przeciwnik, z jakim przyjdzie mu się zmierzyć tej nocy, bo Lex prezentuje bohaterowi Supermana, który wypełnia teraz jego rozkazy. Luthor nie chce dopuścić do sytuacji by Ziemię ponownie zaatakowali obcy, dlatego ma własny plan, który pomoże mu ją ochronić.
Batmanowi początkowo udaje się zmylić Supermana, co pozwala mu na ucieczkę na dach. Niestety później już musi zmierzyć się ze Człowiekiem ze Stali. Na szczęście Nietoperz ma przy sobie kawałek kryptonitu, dzięki któremu udaje uwolnić mu się od przeciwnika. Osłabiony Superman spada na ziemię, ale tam dwóch gapiów wrzuca kryptonit do wody, nie wiedząc, że teraz Superman nie jest jednym z tych dobrych.
W laboratorium Bruce bierze kryptonit, jak się okazuje nabrał on Kenta i dał mu fałszywkę, a prawdziwy kryptonit zachował dla siebie, na czarną godzinę. Na miejscu pojawia się Superman, kryptonit osłabia go, ale dzięki swojemu super oddechowi udaje mu się wytrącić niebezpieczny materiał z ręki Batmana. Nietoperz jednak się nie poddaje i wykorzystuje batbota do walki ze Człowiekiem ze Stali. Nad dachach Gotham City rozgrywa się emocjonującą walka pomiędzy dwoma bohaterami. Relację ze starcia w telewizji ogląda Lex. Superman doszczętnie niszczy zbroje Batmana, na szczęście bohaterowi pomaga Robin, który rakietami atakuje Człowieka ze Stali.
Bohaterom udaje się uciec do fabryki. Obaj zakładają maski przeciw gazaowe, a Batman odkręca gaz. Gdy na miejscu pojawia się Superman, działania gazu, zabójczego dla roślin, przywraca Kryptończyka do normalności.
W LexCorp, Luthor przygotowuje się do wystrzelania swoich robotów. Superman rusza by je zatrzymać, a Batman i Robin udają się do panelu kontrolnego. Kiedy sprawy wymykają się z rąk złoczyńcy, Luthor ucieka. Merci próbuje zatrzymać bohaterów, lecz zostaje pokonana.
Z piwnicy wyłania się olbrzymi robot, za którego sterami siedzi Luthor. Batman umieszcza na ramieniu robota specjalny elektroniczny batarang, który zakłóca działanie zabawki Lexa. Dzięki temu Superman bez problemów go niszczy.
W siedzibie Justice League, Batman dostaje wiadomość od Robina, że Lex trafił do więzienia. Chwilę później pojawia się Supermana, Nietoperz oddaje mu tym razem prawdziwy kryptonit, Człowiek ze Stali postanawia go jednak zostawić w rękach kogoś innego, tak na wszelki wypadek. Następnie Superman pyta się o szczegóły funkcjonowania Justice League.
